Se dice que su poder es comparable al de las Armas Ancestrales, la "carta de triunfo" de la Marina, "La Piedra Dyna", fue robada. El responsable es el temido y terriblemente poderoso, ex-Almirante de la Marina, un hombre llamado "Z", quien se cruza en el camino de los Piratas del Sombrero de Paja. El Cuartel General de la Marina se mueve hacia adelante para hacer frente a esta conspiración, que es capaz de hacer temblar los pilares del Nuevo Mundo. Por otra parte el ex-almirante Aokiji, persigue a los Sombreros de Paja por el Nuevo Mundo, mientras estos deciden enfrentar a Z y a su tripulación con su increíble poder.

Juste avant les vacances d'été, un lycéen nommé Daichi Manatsu voit un étrange arc-en-ciel au-dessus de l'île de Tanegashima et décide de s'y rendre pour jeter un coup d'œil, car cet arc-en-ciel lui paraît familier. Celui-ci lui rappelle la mort de son père ainsi que sa rencontre avec une fille et un garçon mystérieux.